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Staphylococcus aureus Colonisation parmi les contacts domestiques des patients présentant des infections cutanées: Facteurs de risque, discordance des souches et écologie complexe

Contexte L’antécédent génétique du SARM Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline USA300 est rapidement apparu comme la principale cause des infections à S. aureus dans la communauté aux États-Unis. Cependant, les caractéristiques épidémiologiques de la transmission domestique sont mal comprises. Méthodes Nous avons réalisé une étude transversale des adultes et des enfants L ‘infection à S. aureus et ses contacts familiaux à Los Angeles et à Chicago ont été étudiés pour la colonisation des nares, de l’ oropharynx et de la région inguinale et des facteurs de risque de S aureus. Tous les isolements ont été soumis à un typage génétique. 812 membres de ménage La caractéristique la plus commune d’isolat d’infection était ST8 / SCCmec IV, PVL SARM États-Unis300 53% S aureus colonisés 40% 137/350 des patients indexés et 50% 405/812 des contacts domestiques Une enquête sur les naires seulement aurait raté 48% de S aureus et 51% des personnes colonisées par le MRSA Soixante-cinq pour cent des ménages ont eu & gt; 1 S le fond génétique de l’aureus identifié et 26% des isolats de SARM dans les contacts familiaux étaient discordants avec les facteurs de type souche MRSA infectant les patients de l’index Facteurs indépendamment associés P & lt; Contre-indications Dans notre population étudiée, USA300 MRSA est apparu plus transmissible parmi les membres du ménage par rapport à d’autres antécédents génétiques de S aureus. La répartition des souches était complexe; Un contexte génétique S aureus était présent dans de nombreux ménages. Les stratégies de décolonisation de S aureus peuvent nécessiter une prise en charge de la colonisation extra-nasale et les conséquences de l’éradication des antécédents génétiques de S aureus rarement associés à l’infection.

L’émergence d’infections à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline CA-MRSA à la fin des années 1990 [1] a entraîné un changement dramatique de l’épidémiologie des infections à S. aureus aux Etats-Unis, le clone CA-MRSA prédominant, USA300 MRSA, est devenu la cause la plus fréquente d’infection cutanée associée à la communauté [2] et pathogène endémique dans de nombreux hôpitaux [3-5] Les données suggèrent que les infections à SARMoc ont des taux d’attaque élevés dans les contacts familiaux après une infection CA-MRSA initiale [ 6, 7] Contrairement aux souches de SARM associées aux soins de santé, qui circulent dans le milieu de la santé depuis plus de 40 ans et se propagent rarement à l’extérieur de l’hôpital [8-10], il existe des preuves que les souches de SARM propagation d’une personne à l’autre dans les ménages [11-14] Bien que la transmission du SARM-HA puisse se produire en partie par des porteurs asymptomatiques [8], on en sait moins sur le SARM et la dissémination de S. aureus sensible à la méthicilline. Les enquêtes sérieuses sur la propagation du SARM dans les ménages ont été limitées par la taille relativement petite de l’échantillon [15-21], le manque de diversité géographique [16, 19-22], le SARMH [23, 24], la surveillance uniquement des narines [17 , 19, 20, 22, 25, 26], ou l’absence de distinction entre les antécédents génétiques de S aureus au niveau moléculaire [23] Des études récentes suggèrent que le dépistage des narines peut sous-estimer la prévalence de la colonisation par S aureus parce que S aureus colonise l’oropharynx [27-29] et inguinales [30-32] chez les personnes sans colonisation nasale En outre, bien que le SARM USA300 soit le contexte génétique le plus fréquent causant une infection cutanée CA-S aureus [2], la colonisation nasale par SARM reste rare dans la population générale <5% [33] Pour mieux comprendre la propagation du SARM USA300 et d'autres types de souche S aureus dans les ménages, nous avons étudié la colonisation de S aureus chez des patients infectés par la peau et chez leurs membres dans 2 grandes villes américaines.

Méthodes

Nous avons effectué une étude transversale des enfants et des adultes atteints d’infection cutanée à S aureus et de leurs membres de la famille. Les patients ont été inscrits du Harbor-UCLA Medical Center à Torrance en Californie et du Chicago Medical Center à Chicago, en Illinois, d’août 2008 à Juin 2010 Le laboratoire de microbiologie clinique de chaque centre a été testé quotidiennement pour de nouvelles cultures cutanées S aureus Les patients hospitalisés et ambulatoires étaient éligibles S aureus a été identifié par des techniques standard Vitek 2, bioMérieux Les patients étaient éligibles s’ils avaient été prélevés d’une infection cutanée 2 étaient disposés à fournir un consentement éclairé, 3 avaient un membre du ménage qui participerait, et 4 résidaient dans un rayon de 25 miles du centre médical du site. Les patients qui vivaient dans un centre de vie collectif ou étaient sans abri n’étaient pas éligibles. patients indexés “Cette étude a été approuvée par le comité d’évaluation institutionnel de chaque site

Visite à domicile

Le personnel de recherche a administré un questionnaire normalisé sur les facteurs de risque du SARM en se fondant sur des enquêtes antérieures sur le SARM-AC connu ou hypothétique et Facteurs de risque de SARM [8, 13, 30, 34-43] Les questions de cette étude ont été affinées à l’aide d’interviews cognitives [44] [44] Pour évaluer la colonisation de S aureus, le personnel de recherche a obtenu des cultures distinctes des narines et de l’oropharynx. applicateur de pourboire CultureSwab, BD Diagnostic Systems Les cultures inguinales ont été obtenues par le sujet ou son parent / tuteur en privé après avoir reçu des instructions détaillées

Cultures pour la colonisation

Après la collecte, les écouvillons ont été transportés rapidement au laboratoire de recherche du site et enrichis en bouillon de soja trypticase avec du chlorure de sodium à 7% pendant une nuit à 37 ° C. C Les isolats ont été confirmés comme S aureus par des tests de catalase positive et de StaphAureux Remel

Caractérisation Moléculaire Des Isolats Et Définition De La Relation D’isolat

L’ADN génomique a été extrait de chaque isolat à l’aide du kit Qiagen DNeasy Blood and Tissue en suivant les instructions du fabricant et modifié par incubation avec de la lysostaphine dans un tampon de remise en suspension à 37 ° C. 30 minutes pour faciliter la lyse de S aureus [45] La spéciation de Staphylococcusaureus a été confirmée en utilisant une réaction en chaîne de la polymérase PCR test spécifique pour le codage du spa Protéine A Les isolats de Staphylococcus aureus ont été caractérisés par typage multilocus MLST [46] pour déterminer le fond génétique. l’élément SCCmec, l’élément génétique mobile qui porte le typage mecA [47] SCCmec a été réalisé par PCR comme décrit [48], avec des affectations de type utilisant des lignes directrices publiées [47] [47] La ​​détection des gènes codant pour la leucocidine est réalisée 49] Deux isolats de S. aureus étaient considérés comme indiscernables s’ils partageaient Le même type de MLST et SCCmec et concordant en ce qui concerne la présence ou l’absence des déterminants génétiques PVL Basé sur une enquête précédente démontrant que ST8 / PVL / SCCmec IV est hautement concordant avec USA300 MRSA fond génétique évaluée par électrophorèse en champ pulsé M David et al, données non publiées, isolats avec ces caractéristiques ont été classés comme USA300 MRSA

Abstraction de graphiques et critères pour CA S aureus

Nous avons examiné les dossiers médicaux des patients indexés à l’aide d’un instrument d’abstraction standardisé qui a quantifié les hospitalisations récentes, les infections à S aureus et les comorbidités à l’aide d’un index standard [50] infection en CA ou HA [51]

Analyses statistiques

Les données ont été analysées en utilisant le logiciel SAS version 913; L’analyse bivariée a été réalisée en utilisant χ2 ou un test exact de Fisher, le cas échéant. Des procédures de modélisation multivariée [52] ont été réalisées pour prédire la colonisation du patient avec leur type de souche infectante Des procédures similaires expliquant le regroupement des membres du ménage ont été utilisées pour prédire la colonisation des membres du ménage avec le type de souche infectant les patients indexés Toutes les variables avec une valeur P ≤10 dans l’analyse bivariée ont été incluses dans une analyse de régression logistique multivariée. a été réalisée en utilisant le test du rapport de vraisemblance pour identifier le modèle optimal pour les facteurs de risque associés à la colonisation du patient index. L’élimination en retour a été réalisée en utilisant le test Score pour trouver le meilleur modèle de facteurs de risque associés à la colonisation. o f ajustement à l’aide du test de Hosmer-Lemeshow Toutes les variables ont été considérées comme significatives au niveau α = 05

RÉSULTATS

Nous avons dépisté 2097 patients atteints d’infections cutanées à S aureus et avons réussi à contacter 877 patients par téléphone ou par hospitalisation. De ce nombre, 710/877 patients étaient éligibles; parmi les patients éligibles, 502/710 71% ont accepté verbalement de participer Les visites du ménage ont été complétées parmi 356 71% de ceux qui ont accepté de participer Les 146 ménages restants n’ont jamais programmé une visite à domicile ou n’étaient pas présents lorsque le personnel de recherche est arrivé à la maison. 179 ménages à Los Angeles et 177 ménages à Chicago Six ménages à Los Angeles ont été exclus de l’analyse parce que le patient a été envoyé dans un établissement de soins de longue durée n = 1, incapable de planifier une visite d’étude n = 1, ou l’isolat non confirmé comme S aureus au cours de la caractérisation moléculaire n = 4

Caractéristiques des patients de l’index et définitions des cas épidémiologiques

Parmi les 350 ménages, la taille moyenne du ménage était de 53 membres 53 à Los Angeles et 54 à Chicago et le nombre moyen de membres du ménage inscrits était de 34 33 à Los Angeles et de 35 à Chicago Caractéristiques démographiques, cliniques et comportementales des 350 patients indexés sont présentés dans le tableau 1 Par catégorisation épidémiologique, 111 32% des patients avaient le SARM-CA, 122 35% avaient le SARM-AH, 45 13% avaient le CA-MSSA, et 72 20% avaient des infections HA-MSSA. et cou dans 16% 56/350, tronc dans 16% 57/350, bras dans 18% 63/350, fesses / organes génitaux dans 19% 66/350, et jambe dans 38% 132/350 Fait à noter, 18 patients 5% eu des infections cutanées dans> 2 endroits anatomiques

Femme 180 51 26 63 154 50 175 89, 342 11 Homme 170 49 15 37 155 50 … … … Âge Âge plus âgé 65 ans 15 4 2 5 13 4 130 27, 622 74 Adulte 19-65 ans 180 51 19 46 161 52 Ref … … Enfant 5-18 ans 55 16 8 20 47 15 144 59, 350 42 Jeune enfant & lt; 5 ans 100 29 12 29 88 28 116 54, 249 71 Ethnicité Afro-américaine 177 51 24 58 153 50 120 34, 432 78 Caucasien 26 7 3 7 23 7 Ref … … Hispanique 121 35 12 29 109 35 084 22, 323 81 Autre / mixte / inconnu 26 7 2 5 24 8 064 10, 418 64 Facteurs cliniques score de comorbidité de Charlson Moyenne ± SD 1 ± 2 1 ± 2 1 ± 2 092 78, 108 30 Plage médiane 0 0-14 0 0-12 0 0-14 … … … Comorbidités Diabète 57 16 5 12 52 17 069 26, 183 45 Infection par le VIH 14 5 0 0 14 14 NA NA 39 Au cours des 12 derniers mois: A eu un précédent infection cutanée 217 62 23 56 194 63 076 39, 146 41 Chirurgie majeure subie 88 25 12 29 76 24 127 62, 261 52 Dialyse reçue 8 2 0 0 8 3 SO NA 60 Hospitalisée 172 49 18 44 154 50 079 41, 152 48 Jours d’hospitalisation Moyenne ± SD 4 ± 18 3 ± 8 4 ± 19 099 97, 102 82 Allocation médiane 0 0-320 0 0-39 0 0-320 … … … Toute exposition aux antibiotiques 237 67 24 59 213 69 064 33, 124 18 Utilisation de la clindamycine 35 10 7 18 28 9 207 86, 509 16 Utilisation de TMP-SMX 37 11 3 8 34 11 065 19, 218 78 Utilisation de la céphalexine 17 5 2 5 15 5 102 23, 465 99 Utilisation de médicaments immunosuppresseurs 70 20 9 23 61 20 115 52, 257 72 Temps passé à vivre dans un établissement spécialisé de soins infirmiers, centre de réadaptation ou autre type d’établissement de groupe 8 2 2 5 6 2 268 52, 1374 23 Facteurs épidémiologiques Densité des ménages Moyenne ± SD 196 ± 108 194 ± 093 196 ± 110 099 73, 135 94 Fourchette médiane 173 040- 90 166 0667-40 20 040-90 … … … Itinérance au cours des 12 derniers mois 14 4 3 7 11 3 214 57, 801 22 Coupures / éraflures dans les 30 jours précédant l’infection par l’indice 143 41 19 46 124 40 129 67, 248 50 Éruption cutanée dans les 90 jours précédant l’infection par l’index 60 18 14 36 46 16 297 144, 617 002a Animaux domestiques à la maison, actuellement 156 45 15 38 141 46 0702 36, 138 32 Incarcération au cours des 12 derniers mois 9 4 0 0 9 5 – – 60 Consommation de drogues illicites au cours des 12 derniers mois 34 10 1 2 33 11 021 03, 157 15 & gt; 1 partenaire sexuel au cours des 12 derniers mois 25 12 3 12 22 12 102 29, 370 99 Au cours des 3 derniers mois: Douche au moins une fois par jour 39 12 4 11 35 12 091 30, 271 99 Maquillage partagé avec les autres 20 7 2 5 18 7 076 17, 342 99 193 57 25 63 168 56 132 67, 260 42 Vêtements partagés avec d’autres personnes lavées 21 6 3 7 18 6 125 35, 444 73 Serviettes partagées avec d’autres 157 46 21 51 136 45 130 67, 249 43 Portaient des vêtements plus d’une fois sans se laver 166 49 23 58 143 47 148 76, 287 25 Fréquence de lavage des mains après l’utilisation de la salle de bain Moyenne ± écart-type 26 ± 078 26 ± 080 26 ± 078 101 66, 154 97 Échelle médiane 3 0-3 3 0-3 3 0-3 Échelle de nettoyage ménager Moyenne ± écart type 16 ± 8 17 ± 8 16 ± 8 118 62, 220 61 Échelle médiane 18 0-35 18 0-33 18 0 -35 Utilisation d’un gymnase 27 14 5 14 22 9 156 55, 442 38 Participation aux sports de contact 83 24 11 27 72 23 121 58, 253 62 Va à la garderie 25 19 1 7 24 21 027 03, 219 30 Utilisation du public facilitiesc 76 22 12 29 64 21 158 77, 327 21 Facteurs spécifiques des souches Catégorisation des types de souches infectieuses par la définition de cas de CDC CA-MRSA 111 32 15 37 96 31 128 65, 253 92 HA-MRSA 122 35 17 42 105 34 Réf. -MSSA 45 13 3 7 42 14 050 15, 170 29 HA-MSSA 72 20 6 15 66 21 063 26, 156 28 ST8-MRSA-Mec souche IV-PVL type 186 53 29 71 157 51 233 115, 475 02 PVL présence 266 76 33 81 233 75 074 33, 167 56 SCCmec type IV 220 63 30 73 190 62 171 82, 354 17 Autre ménage les membres colonisés avec le type de souche d’infection 81 23 21 51 60 19 436 222, 855 & 001d Les relations statistiquement significatives sont en caractères gras; NA indique ne peut pas être calculé en raison de l’absence de toute agrégation cellulaire: SARM-CA, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associé à la communauté; CA-MSSA, S aureus sensible à la méthicilline et associé à la communauté; CDC, Centres de contrôle et de prévention des maladies; CI, confiance inverval; HA-MRSA, S aureus résistant à la méthicilline associé aux soins de santé; HA-MSSA, S aureus sensible à la méticilline et associé aux soins de santé; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; OU, odds ratio; PVL, leucocidine Panton-Valentine; Réf, groupe de référence; SD, écart-type; TMP-SMX, triméthoprime-sulfaméthoxazole Valeur variable dans l’analyse multivariée OR, 29 [14-62]; P = 006bLe ménage est une mesure de la fréquence de nettoyage des articles ménagers courants, avec des valeurs plus élevées représentant un nettoyage plus fréquent. L’utilisation des installations publiques est définie comme l’utilisation d’une salle de sport, d’un vestiaire, d’une douche, d’une piscine ou d’un JacuzzidVariable. en analyse multivariable OR, 43 [21-86]; P & lt; 001View Large

Types de souches d’isolats infectant les patients de l’index

Parmi les isolats infectants des patients index, la majorité 233, 67% étaient SARM, 117 33% étaient MSSA, et 266 76% étaient PVL Parmi les 233 isolats de SARM, 220 945% contenaient SCCmec type IV, 6 25% contenaient SCCmec type II, 6 25% contenaient SCCmec type III et 1 05% contenait un élément SCCmec non typable Parmi les isolats des sujets infectants, 230 66% étaient ST8 et 186 53% étaient USA300 MRSA Le fond génétique des isolats des patients indexés est résumé dans le tableau 2

Tableau 2Comparaison des souches d’infection de l’index, des souches colonisatrices de l’index et des souches de colonisation des membres du ménage circulant dans les ménages SARM ou MSSA ST Type SCCmec Type Indice PVL Type de souche infectante, n = 350% Type de souche colonisatrice, n = 215% , n = 594% P Valuea SARM 8 IV 186 53 57 27 178 30 & lt; 001 MRSA 8 IV 8 2 3 1 6 1 18 MRSA 8 IV – 9 3 0 0 5 1 02 SARM 5 IV – 3 1 3 1 3 1 99 SARM 5 II – 3 1 6 3 8 1 30 SARM 239 III 6 2 7 3 7 1 99 SARM 1 IV 1 1 0 0 3 1 99 SARM 30 IV 1 1 0 0 3 1 99 SARM Divers Varié Varié 16 3 15 7 28 4 59 SASM 8 Aucune 27 8 9 4 27 5 03 SASM 8 Aucune – 5 1 3 1 22 4 11 SASM 5 Aucune – 6 2 23 11 42 7 & lt; 001 SASM 15 Aucune – 3 1 3 1 33 6 001 MSSA 30 Aucune – 5 1 13 6 47 8 & 001 SASM 45 Aucune – 2 1 12 6 33 6 & 001 SASM 72 Aucune – 1 1 9 4 20 3 & 001 MSSA 1 N un 5 1 0 0 0 0 & lt; 001 MSSA 188 Aucune – 4 1 6 3 12 2 22 MSSA Miscb Aucune Variée 59 17 46 21 117 20 22 SARM ou MSSA ST Type SCCmec Type Indice PVL Type de souche infectant, n = 350% Index Type de souche colonisatrice, n = 215% Type de souche colonisatrice du membre du ménage, n = 594% P Valuea SARM 8 IV 186 53 57 27 178 30 & lt; 001 SARM 8 IV 8 2 3 1 6 1 18 SARM 8 IV – 9 3 0 0 5 1 02 SARM 5 IV – 3 1 3 1 3 1 99 MRSA 5 II – 3 1 6 3 8 1 30 SARM 239 III 6 2 7 3 7 1 99 SARM 1 IV 1 1 0 0 3 1 99 SARM 30 IV 1 1 0 0 3 1 99 SARM Divers Variées variées 16 3 15 7 28 4 59 SASM 8 Aucune 27 8 9 4 27 5 03 SASM 8 Aucune – 5 1 3 1 22 4 11 SASM 5 Aucune – 6 2 23 11 42 7 & lt; 001 SASM 15 Aucune – 3 1 3 1 33 6 001 SASM 30 Aucune – 5 1 13 6 47 8 & 001 SASM 45 Aucune – 2 1 12 6 33 6 & 001 SASM 72 Aucune – 1 1 9 4 20 3 & 001 MSSA 1 Aucune 5 1 0 0 0 0 & lt; 001 MSSA 188 Aucune – 4 1 6 3 12 2 22 MSSA Miscb Aucun Varié 59 17 46 21 117 20 22 Abréviations: Divers, divers; SARM, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline; SASM, S aureus sensible à la méthicilline; PVL, leucocidine Panton-Valentine; Type SCCmec, type staphylococcique chromosome mec type; Type ST, type de séquence par typage de souche multilocus La valeur représente la proportion du type de souche causant l’infection par rapport à la proportion provoquant la colonisation chez les membres de l’index et du ménageb Les types de souche “Divers” représentent 106 autres types de souche.

Colonisation chez les patients de l’indice

Parmi les patients indexés, 137/350 40% ont été colonisés par S aureus La colonisation nasale était présente chez 75 22% des patients, la colonisation oropharyngée chez 64 19%, et la colonisation inguinale chez 76 22% La colonisation non nasale a été retrouvée chez 34% des 117/350 sujets , tandis que 6% 24/350 étaient colonisés seulement dans l’oropharynx et 8% 30/350 seulement dans la région inguinale. Tableau 3 En incluant leur souche infectante, 71% 247/350 des patients index avaient 1 souche S aureus, 24% 84 / 350 avaient 2 types de souches, et 5% 19/350 avaient 3 types de souches isolés de leur corps

133 16 47 18 48 19 15 15 23 12 & lt; 001 Nasal seulement Tout S aureus 20 6 8 8 3 2 2 9 5 7 42 73 9 19 7 25 10 11 11 18 10 14 MSSA 13 4 5 5 0 0 2 9 4 6 15 37 5 11 4 13 5 5 5 11 6 26 MRSA 7 2 3 3 3 3 0 0 1 1 57 36 4 8 3 12 5 6 6 7 4 41 Oropharynx seulement Tout S aureus 24 6 13 12 5 5 4 9 2 3 009 125 15 47 17 34 13 11 11 33 18 & lt; 001 MSSA 13 4 6 6 2 2 3 7 2 3 35 92 11 33 12 23 9 7 7 29 16 & lt; 001 MRSA 11 2 7 6 3 3 1 2 0 0 08 33 4 14 5 11 4 4 4 2 03 Région inguinale seulement Tout S aureus 30 8 8 8 17 14 3 7 7 10 14 57 7 18 6 18 7 9 9 12 6 23 MSSA 18 4 4 4 0 0 2 5 5 7 41 31 4 9 3 10 4 6 6 6 3 65 SARM 12 4 4 4 17 14 1 2 2 3 34 26 3 9 3 8 3 3 3 6 3 36 Index Patients Membres du ménage Site de colonisation Tous, n = 350% SARM-CA, n = 111% HA-SARM, n = 122% CA-MSSA, n = 45% HA-MSSA, n = 72% p valeur tout, n = 812% CA-MRSA, n = 268% HA-MRSA, n = 258% CA-MSSA, n = 100% HA-MSSA, n = 186% P Valeur Tout site du corps Tout S aureus 137 40 45 41 40 33 18 40 34 47 007 405 50 134 50 125 49 45 45 101 54 & lt; 001 MSSA 86 25 27 24 17 14 15 33 27 40 13 267 33 86 32 73 28 29 29 79 42 & lt; 001 MRSA 62 18 21 19 27 22 3 7 11 15 & lt; 001 177 22 61 23 61 24 22 22 33 17 & l 001 Nasal Tout S aureus 75 22 23 21 20 16 11 24 21 30 21 205 25 61 23 68 26 25 25 51 28 & lt; 001 MSSA 47 14 15 14 5 4 10 22 17 24 06 116 14 35 13 34 13 11 11 15 8 002 MRSA 28 8 8 7 15 12 1 2 4 6 001 89 11 26 10 34 13 14 14 36 20 007 Oropharynx Tout S aureus 64 19 23 21 19 16 8 18 14 19 049 236 30 81 31 72 28 22 22 61 34 & lt; 001 SASM 36 11 12 11 6 5 7 16 11 15 41 160 20 55 21 42 16 13 13 50 28 & 001 MRSA 28 8 11 10 13 11 1 2 3 4 002 76 10 26 10 30 12 11 11 11 6 & lt; 001 Région inguinale Tout S aureus 76 22 18 16 28 23 7 17 23 32 005 154 19 53 20 50 19 18 18 33 18 & lt; 001 MSSA 41 12 10 9 11 9 5 12 15 21 18 77 10 26 10 21 8 11 11 19 10 11 MRSA 35 10 8 7 17 14 2 5 8 11 004 77 10 27 10 29 11 7 7 14 8 & lt; 001 Colonisation à & gt; 1 corps Saureus 63 18 16 14 20 16 7 16 20 28 67 150 18 50 18 48 18 14 14 38 20 & lt; 001 MSSA 42 12 12 11 8 7 6 13 16 22 13 107 13 36 13 27 10 11 11 33 18 003 SARM 31 9 7 6 16 13 1 2 7 10 002 75 9 22 8 29 11 9 9 15 8 007 Nonnasal Tout Saureus 117 34 37 33 37 31 14 31 29 41 007 332 41 115 44 100 39 34 34 83 44 & lt; 001 MSSA 69 20 21 19 15 12 11 24 22 31 20 217 27 75 28 56 22 23 23 75 40 & lt ; 001 MRSA 52 15 17 15 23 19 3 7 9 13 & 001 133 16 47 18 48 19 15 15 23 12 & lt; 001 Nasal seulement Tout S aureus 20 6 8 8 3 2 2 9 5 7 42 73 9 19 7 25 10 11 11 18 10 14 MSSA 13 4 5 5 0 0 2 9 4 6 15 37 5 11 4 13 5 5 5 11 6 26 SARM 7 2 3 3 3 3 0 0 1 1 57 36 4 8 3 12 5 6 6 7 4 41 Oropharynx seulement Tout S aureus 24 6 13 12 5 5 4 9 2 3 009 125 15 47 17 34 13 11 11 33 18 & lt; 001 MSSA 13 4 6 6 2 2 3 7 2 3 35 92 11 33 12 23 9 7 7 29 16 & lt; 001 MRSA 11 2 7 6 3 3 1 2 0 0 08 33 4 14 5 11 4 4 4 2 03 Région inguinale seulement Tout S aureus 30 8 8 8 17 14 3 7 7 10 14 57 7 18 6 18 7 9 9 12 6 23 SASM 18 4 4 4 0 0 2 5 5 7 41 31 4 9 3 10 4 6 6 6 3 65 MRSA 12 4 4 4 17 14 1 2 2 3 34 26 3 9 3 8 3 3 3 6 3 36 Les valeurs de P représentent des comparaisons entre groupes dans une rangée donnée. Les valeurs de P signifient que 1 groupe a une proportion statistiquement différente des autres groupes. Abréviations: CA-MRSA, communauté- Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associé; CA-MSSA, S aureus sensible à la méthicilline et associé à la communauté; HA-MRSA, S aureus résistant à la méthicilline associé aux soins de santé; HA-MSSA, S aureusView LargeAmong index patients sensibles à la méticilline, 12% 41/350 ont eu & gt; 1 type de souche colonisante concordant avec leur isolat infectant et 27% 96/350 ont été colonisés avec un type de souche S aureus discordant de leur Parmi les patients infectés par le SARM, 14% 32/233 portaient une souche concordante et 25% 57/233 présentaient une souche discordante de souche S. aureus Parmi ces 57 souches discordantes S aureus, 28% 16/57 étaient des souches discordantes de SARM. types Parmi les personnes infectées par une souche MSSA, 8% 9/117 portaient un type de souche concordant et 39% 46/117 portaient un type de souche S aureus discordant. Parmi ces 46 types discordants de souche S aureus, 72% 33/46 ont été colonisés par d ‘autres espèces. Types de souches de MSSA Parmi les patients infectés par SARM USA300, un portage concordant est survenu chez 16% 29/186 et 23% 43/186 sur un type de souche S aureus discordant. Parmi ces 43 types de souches discordantes, 23% 10/43 étaient des souches non USA300 MRSA typesFactors associés à co La lonisation avec le type de souche infectieuse dans l’analyse bivariée est décrite dans le tableau 1. Dans le modèle multivarié, les prédicteurs indépendants de la colonisation avec le type de souche infectante étaient des éruptions cutanées dans les 90 jours avant odds ratio [OR], 29 [14-62]; P = 006 et ayant ≥1 membres du ménage colonisés avec la souche d’infection type OR, 43 [21-86]; P & lt; 001

Colonisation des contacts familiaux

Parmi les 826 membres du ménage, 14 ont refusé les écouvillons de colonisation corporelle. Les données démographiques et les comorbidités des 812 contacts familiaux sont résumées au tableau 4. 24% 197/812 des membres du ménage ont signalé une infection cutanée au cours des 12 mois précédents et 50% 405 / 812 ont été colonisés avec S aureus Les données de colonisation sont fournies dans le tableau 3 Globalement, 33% 267/812 des membres du ménage ont été colonisés avec MSSA et 22% 177/812 avec SARM 41% ont été colonisés avec 1 type de souche, 8% 63/812 avec 2 types de souches et 1% 9/812 avec 3 types de souches

s Sexe Féminin 510 63 63 57 447 65 096 92, 101 13 Masculin 294 37 48 43 246 36 … … … Âge Âge adulte plus âgé 65 ans 36 4 5 5 31 5 101 90, 113 85 Adulte 19-65 ans 492 61 67 60 425 61 Ref … … Enfant 5-18 ans 175 22 27 24 148 21 102 95, 108 59 Jeune enfant & lt; 5 ans 109 13 12 11 97 14 097 91, 103 33 Ethnicité Afro-Américain 412 51 53 48 359 51 106 97, 116 18 Caucasien 48 6 3 3 45 6 Ref … … Hispanique 300 37 50 45 250 36 111 1001, 122 03 Autre / mixte / inconnu 52 6 5 5 47 7 102 91, 114 69 Facteurs cliniques Score de comorbidité de Charlson Moyenne ± SD 0 ± 1 0 ± 1 0 ± 1 098 96, 100 16 Plage médiane 0 0-7 0 0-6 0 0-7 … … … Comorbidités Diabète 71 9 9 8 62 9 099 91, 107 73 Infection par le VIH 8 2 1 1 7 2 099 82, 119 91 Au cours des 12 derniers mois Avait eu une infection cutanée précédente 197 25 45 41 152 23 112 104, 119 & lt; 001a Chirurgie majeure subie 59 7 4 4 55 8 094 87, 101 07 Dialyse reçue 1 012 0 0 1 014 NA NA 99 Hospitalisée 101 13 15 14 86 13 101 93, 108 88 Jours d’hospitalisation Moyenne ± SD 05 ± 2 05 ± 2 05 ± 2 100 98, 101 93 Fourchette médiane 0 0-30 0 0-21 0 0-30 … … … N’importe quel antibiotique exposition 248 31 43 39 205 30 105 99, 111 11 Utilisation de la clindamycine 12 2 4 4 8 1 122 89, 167 22 Utilisation de TMP-SMX 11 1 4 4 7 1 123 96, 158 09 Utilisation de la céphalexine 15 2 7 6 8 1 139 106, 178 02b Utilisation de médicaments immunosuppresseurs 78 10 14 13 64 9 104 95 , 114 42 Temps passé dans un établissement de soins infirmiers spécialisé, un centre de réadaptation ou un autre type d’établissement de groupe 19 2 2 2 17 3 095 84, 107 41 Facteurs épidémiologiques Densité du ménage Moyenne ± ÉT 20 ± 098 22 ± 092 20 ± 098 101 99 , 104 33 Fourchette médiane 20 033-60 22 071-60 20 033-60 … … … Itinérance au cours des 12 derniers mois 40 5 5 5 35 5 099 89, 111 99 Coupures / égratignures dans les 30 jours avant l’infection par l’index 308 38 51 46 257 37 105 99, 111 07 Éruption cutanée dans les 90 jours précédant l’infection par l’index 87 11 18 17 69 10 109 99, 118 06 Animaux domestiques à la maison actuellement 339 42 47 43 292 42 1 01 95, 106 83 Incarcération au cours des 12 derniers mois 21 3 3 4 18 3 102 87, 119 86 Consommation de drogues illicites au cours des 12 derniers mois 66 11 11 14 55 11 105 96, 115 26 & gt; 1 partenaire sexuel au cours des 12 dernières années mo 73 12 9 12 64 12 099 92, 107 80 Au cours des 3 derniers mois Douche au moins une fois par jour 131 16 23 21 108 16 104 97, 111 32 Maquillage partagé avec les autres 88 12 13 13 75 11 101 93, 110 82 Savon en barre partagé avec les autres 496 63 67 63 429 63 100 95, 105 96 Vêtements partagés avec les autres sans se laver 51 6 8 7 43 6 103 94, 113 53 Serviettes partagées avec les autres 389 48 55 50 334 48 102 97, 107 42 Wore vêtements plus d’une fois sans lavage 400 50 58 53 342 49 102 97, 107 42 Fréquence de lavage des mains après utilisation de la salle de bain Moyenne ± écart-type 27 ± 062 27 ± 076 28 ± 060 097 92, 101 20 Plage médiane 3 0-3 3 0-3 3 0-3 … … … Ménage nettoyage scalec Moyenne ± SD 17 ± 7 17 ± 8 17 ± 7 099 99, 100 17 Plage médiane 18 0-34 18 0-29 18 0- 34 … … … Utilisation d’un gymnase 87 12 10 10 77 12 098 92, 105 59 Participation aux sports de contact 201 25 33 30 168 24 104 98, 110 23 Va à la garderie 30 16 3 10 27 17 092 82, 102 10 Utilisation des établissements publicsd 224 28 32 29 192 28 100 96, 106 86 Facteurs spécifiques de la souche Catégorisation de la souche affectant par la définition de cas CDC CA-MRSA 268 33 39 35 229 33 095 88, 101 12 HA-MRSA 258 32 52 47 206 29 Ref … … CA-MSSA 100 12 8 7 92 13 089 82, 97 008 HA-MSSA 186 23 12 11 174 25 088 82, 94 003 Souche d’infection ST8-IV-PVL type 442 5 4 87 78 355 51 113 108, 119 & lt; 001e présence PVL 622 77 95 86 527 75 107 101, 113 03 SCCmec type IV 503 62 89 80 414 59 110 105, 116 & lt; 001 Les relations statistiquement significatives sont en gras; NA indique ne peut pas être calculé en raison de l’absence de toute agrégation cellulaire: SARM-CA, Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline associé à la communauté; CA-MSSA, S aureus sensible à la méthicilline et associé à la communauté; CDC, Centres de contrôle et de prévention des maladies; CI, intervalle de confiance; HA-MRSA, S aureus résistant à la méthicilline associé aux soins de santé; HA-MSSA, S aureus sensible à la méticilline et associé aux soins de santé; VIH, virus de l’immunodéficience humaine; OU, odds ratio; PVL, leucocidine Panton-Valentine; Réf, groupe de référence; Type SCCmec, type staphylococcique chromosome mec type; TMP-SMX, triméthoprime-sulfaméthoxazole Valeur variable significative dans l’analyse multivariée OR, 201 [131-308]; P = 001b Variable significative dans l’analyse multivariée OR, 35 [13-95]; P = 01cLe ménage est une mesure de la fréquence du nettoyage pour les articles ménagers courants avec des valeurs plus élevées représentant un nettoyage plus fréquentdUtilisation des installations publiques est définie comme l’utilisation d’un gymnase, un vestiaire, une douche, une piscine, un sauna ou une Jacuzzie. analyse multivariable OR, 30 [17-53]; P = 0002View Large

Types de souches colonisatrices des contacts domestiques

Parmi les 350 ménages, la présence d’une souche de S. aureus circulant parmi les contacts familiaux était fréquente, y compris l’isolat infectant du patient, 35% 123/350 des ménages avaient un seul type de souche identifié, 33% 117/350 avaient 2 types de souches. , 20% 40/350 avaient 3 types de souches, 7% 24/350 avaient 4 types de souches, et 5% 16/350 avaient ≥5 types de souches identifiées. Les antécédents génétiques de S aureus identifiés parmi les membres des ménages sont résumés dans le tableau 2. Le SARM USA300, qui représentait 30% des isolats, représentait 30% des isolats USA300 Le SARM colonisait 16% des SARM-CA, 20% des SARM-A, 16% des SARM-CA et 12% des membres des ménages HA-SASM. / 812 des membres du ménage avaient au moins 1 type de souche colonisatrice concordant avec l’isolat infectant du patient index et 39% 317/812 de leurs types d’isolats colonisateurs étaient discordants Dans les foyers avec un index MRSA infection, 17% 91/526 des contacts portaient un concordant type de contrainte par rapport à 7% 20/286 parmi h Les contacts domestiques, les associations bivariées entre les facteurs de risque hypothétiques de colonisation et le type de souche concordant avec le type de souche infectante du patient de l’index sont décrits dans le tableau 4 En multivariable analyse, prédicteurs significatifs de type de souche concordant avec le type de souche infectante du patient de l’indice inclus infection de la peau précédente OU, 201 [131-308]; P = 001, utilisation de céphalexine au cours des 12 derniers mois OU, 35 [13-95]; P = 01, et le patient index ayant une souche d’infection USA300 de type OR, 30 [17-53]; P & lt; 001

DISCUSSION

Notre enquête sur 350 ménages atteints d’une infection à S. aureus à Los Angeles et Chicago, comprenant 1162 personnes, a démontré la prévalence de la colonisation par S aureus chez les patients indexés et les membres de leur ménage sont élevés, mais les souches colonisatrices sont étonnamment diverses, complexes et souvent non concordantes. En premier lieu, nos données suggèrent que le contexte génétique du SARM USA300 semble se propager plus facilement dans les ménages que d’autres antécédents génétiques. Une infection induite par le contexte génétique du SARM USA300 était un prédicteur indépendant de la colonisation concordante dans un autre ménage. Ces découvertes pourraient expliquer l’émergence de SARM USA300 dans les communautés [53, 54] et les grappes d’infections dans les ménages, les prisons, les casernes militaires et les équipes sportives [54-57]. Le SARM USA300 était très répandu et présent chez ≥1 personnes sur 80 % des ménages avec un index HA-MRSA infection et 26% des ménages w infection à HA-MSSASecond, la colonisation par S aureus des membres du ménage était très commune 50% et plus élevée que la prévalence de 20% -35% de la colonisation nasale communément cité [58-60] Ces résultats reflètent probablement que nous avons étudié 3 sites corporels et utilisé culture de bouillon d’enrichissement Comme pour d’autres études [29-32], l’évaluation de sites anatomiques supplémentaires pour la colonisation de S aureus a révélé une prévalence plus élevée de la colonisation de S aureus. Notamment, une enquête sur la culture de nares aurait manqué de 48% Figure 1 et 51% des personnes colonisées par SARM Ces résultats suggèrent que le développement de schémas de décolonisation réussis pour prévenir l’infection devrait envisager des agents qui éradiquent la colonisation de la peau et de l’oropharynx.

La prévalence étonnamment élevée des antécédents génétiques discordants de MRSA colonisant les contacts 26% suggère que la simple observation de la colonisation par le SARM dans les contacts familiaux des personnes ayant une infection cutanée surestimerait la propagation des patients indexés. «Les clones de SARM au sein du ménage et que beaucoup de ménages dans notre étude avaient <1 S aureus ou même le type de souche SARM circulant Quatrièmement, la colonisation par S aureus chez les patients index 40% était moins fréquente que parmi les contacts domestiques 50% Les ménages ont été visités en moyenne 18 jours Après la culture de l'infection, cette découverte reflète probablement le récent traitement antibiotique des patients qui ont pu éradiquer la colonisation par S aureus. Enfin, nos données démontrent que la distribution des souches pathogènes diffère de celle des souches souche colonisant les patients et leurs contacts familiaux. exemple, USA300 MRSA génétique backgroun d a provoqué 53% des infections mais ne représentait que 29% des types de souches colonisatrices P & lt; 001 Inversement, la séquence type 30 MSSA causait seulement 1% des infections mais était responsable de 74% des isolats colonisateurs Ces résultats suggèrent que certains antécédents génétiques sont des causes improbables de la maladie et que d'autres, comme USA300 MRSA, ont un potentiel pathogène élevé. Alternativement, ces résultats peuvent provenir de la décolonisation des patients infectant la souche USA300 et de la recolonisation subséquente avec des souches moins pathogènes. Comparé à d'autres études sur la dissémination du S. aureus domestique, Il convient de noter que 3 enquêtes européennes et 1 enquête américaine ont montré que tous les types de souche de SARM colonisateurs, tous sauf un, étaient identiques à ceux infectant le patient index [17, 18, 21, 24]. est due au niveau plus élevé de la colonisation endémique à SARM et à la Dans l'étude américaine mentionnée ci-dessus, les résultats peuvent différer des nôtres car l'étude a été menée avant l'émergence de CA-MRSA. Une étude menée dans une zone endémique de CA-MRSA, comme la nôtre, a révélé une discordance chez environ la moitié des isolats colonisant les membres de la famille. [19] Notre étude présente des points forts. patients atteints d'infections cutanées à S. aureus Contrairement à de nombreuses études antérieures sur la colonisation des ménages qui n'ont pas examiné plusieurs sites corporels [17, 19, 20, 22, 23, 25, 26], nous avons évalué 3 sites corporels et entrepris une enquête épidémiologique détaillée. , notre étude a été réalisée dans 2 sites urbains aux États-Unis qui ont différentes distributions de population raciale et ethnique Troisièmement, nous avons effectué le génotypage des isolats A pr Cependant, en l'absence de typage des souches, ce nombre peut être une surestimation. En outre, les prétendus facteurs de risque de transmission du SARM chez les personnes âgées de 20 à 20 ans ont été étudiés. Cette enquête préalable serait biaisée par l'absence de typage des souches Enfin, d'autres études antérieures n'ont pas examiné les facteurs épidémiologiques ou étaient probablement insuffisantes pour détecter des relations significatives [15-21] Il y a des limites à notre étude Premièrement, notre enquête n'a peut-être pas détecté les individus colonisés parce que certaines études ont trouvé une colonisation de S aureus sur les poignets, le rectum, l'aisselle et le vagin [30, 61, 62] Cependant, les rendements de ces sites supplémentaires ont pu être faibles [30, 61, 62] est transversal et ne permet pas de déterminer la directionnalité du transfert de la souche Troisièmement, notre population peut ne pas être représentative des autres populations Les sujets de l'étude proviennent de populations relativement peu Situation socioéconomique aux États-Unis où les infections à SARM sont épidémiques Quatrièmement, le nombre de comparaisons et de tests effectués pour les analyses statistiques peut augmenter la probabilité d'erreur de type 1 En résumé, nous avons constaté que la colonisation par S aureus était très fréquente Étant donné la diversité des souches parmi les isolats de SASM et SARM trouvés dans les membres du ménage, le développement de programmes efficaces de dépistage et de décolonisation des S. aureus peut ne pas être une tâche simple. Il est plausible que la décolonisation élimine les types de souche moins pathogènes. La nature complexe de la colonisation que nous avons observée peut inciter à repenser les stratégies de prévention du SARM Les implications de l'élimination des types de souche de S aureus rarement associés à la maladie ne sont pas claires et doivent faire l'objet d'une étude plus approfondie.

Remarques

Reconnaissances

Nous remercions Everly Macario, Mellie Badar, Ramiro Correa, Sallie Chui et Grace Tagudar pour leur aide dans le développement de l’enquête, la collecte des données d’étude et le traitement des échantillons de laboratoire. Nous remercions également le personnel du Laboratoire de Microbiologie Clinique du Centre Médical UCLA. leur aide à la collecte de spécimens Finalement, nous remercions tous les patients et leurs familles pour leur participation et pour nous avoir permis de visiter leur maison pour cette étude.

Aide financière

Ce travail a été soutenu par une subvention du National Institutes of Health R01 AI067584-01A1

Conflits d’intérêts potentiels

Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués